Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD1P98174 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD1P98174 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGD1P98174 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGD1P98174 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGD1P98174 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGD1P98174 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGD1P98174 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD1P98174 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms