Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms