Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms