Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms