Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABP4P57796 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABP4P57796 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABP4P57796 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABP4P57796 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABP4P57796 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABP4P57796 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABP4P57796 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CABP4P57796 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABP4P57796 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABP4P57796 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CABP4P57796 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CABP4P57796 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CABP4P57796 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CABP4P57796 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CABP4P57796 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CABP4P57796 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CABP4P57796 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CABP4P57796 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABP4P57796 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms