Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX3P56589 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX3P56589 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX3P56589 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX3P56589 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX3P56589 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX3P56589 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX3P56589 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX3P56589 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX3P56589 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX3P56589 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX3P56589 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX3P56589 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX3P56589 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms