Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms