Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC12A2P55011 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms