Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23BP54727 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23BP54727 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms