Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms