Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME1P48163 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME1P48163 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME1P48163 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ME1P48163 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ME1P48163 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ME1P48163 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ME1P48163 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME1P48163 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms