Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTRNP46939 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTRNP46939 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTRNP46939 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTRNP46939 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTRNP46939 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTRNP46939 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTRNP46939 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTRNP46939 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTRNP46939 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTRNP46939 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTRNP46939 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTRNP46939 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms