Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP5P45974 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP5P45974 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP5P45974 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP5P45974 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP5P45974 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP5P45974 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP5P45974 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP5P45974 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP5P45974 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms