Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 TAD1YGL243W 1203 nt0.68□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YHR054CYHR054C 1065 nt0.68□□□□□ -2.3
CCS1P40202 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.68□□□□□ -2.3
CCS1P40202 STB6YKL072W 2301 nt0.68□□□□□ -2.3
CCS1P40202 SAS3YBL052C 2496 nt0.68□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.68□□□□□ -2.3
CCS1P40202 VAM3YOR106W 852 nt0.68□□□□□ -2.3
CCS1P40202 KAP120YPL125W 3099 nt0.68□□□□□ -2.3
CCS1P40202 SWI4YER111C 3282 nt0.67□□□□□ -2.3
CCS1P40202 SPT21YMR179W 2277 nt0.67□□□□□ -2.3
CCS1P40202 SRP14YDL092W 441 nt0.67□□□□□ -2.3
CCS1P40202 LRP1YHR081W 555 nt0.67□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.67□□□□□ -2.3
CCS1P40202 IRC23YOR044W 474 nt0.67□□□□□ -2.3
CCS1P40202 BI4Q0120 1917 nt0.66□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YDR220CYDR220C 294 nt0.66□□□□□ -2.3
CCS1P40202 SMB1YER029C 591 nt0.66□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YKL111CYKL111C 336 nt0.66□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YPL197CYPL197C 414 nt0.66□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YPR147CYPR147C 915 nt0.66□□□□□ -2.3
CCS1P40202 POP7YBR167C 423 nt0.66□□□□□ -2.3
CCS1P40202 HDA3YPR179C 1968 nt0.66□□□□□ -2.3
CCS1P40202 APL3YBL037W 3078 nt0.65□□□□□ -2.31
CCS1P40202 TIM10YHR005C-A 282 nt0.65□□□□□ -2.31
CCS1P40202 SWS2YNL081C 432 nt0.65□□□□□ -2.31
CCS1P40202 SWI5YDR146C 2130 nt0.64□□□□□ -2.31
CCS1P40202 ZIP1YDR285W 2628 nt0.64□□□□□ -2.31
CCS1P40202 NHP2YDL208W 471 nt0.64□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YPT6YLR262C 648 nt0.64□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.64□□□□□ -2.31
CCS1P40202 APL2YKL135C 2181 nt0.64□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YDR521WYDR521W 336 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YGL109WYGL109W 324 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 NBL1YHR199C-A 222 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 SDS22YKL193C 1017 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 NBP1YLR457C 960 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YOP1YPR028W 543 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YPR096CYPR096C 303 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YCS4YLR272C 3531 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 AIM9YER080W 1884 nt0.63□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YCR100CYCR100C 951 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 HNT1YDL125C 477 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YDL152WYDL152W 366 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YGL015CYGL015C 393 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 PRM8YGL053W 714 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YGR228WYGR228W 345 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 RPC10YHR143W-A 213 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 CMC4YMR194C-B 222 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 UTP13YLR222C 2454 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 CLU1YMR012W 3834 nt0.62□□□□□ -2.31
CCS1P40202 MPT5YGL178W 2580 nt0.61□□□□□ -2.31
CCS1P40202 NOC3YLR002C 1992 nt0.61□□□□□ -2.31
CCS1P40202 PAM16YJL104W 450 nt0.61□□□□□ -2.31
CCS1P40202 TMA22YJR014W 597 nt0.61□□□□□ -2.31
CCS1P40202 TOF2YKR010C 2316 nt0.61□□□□□ -2.31
CCS1P40202 NUP145YGL092W 3954 nt0.6□□□□□ -2.31
CCS1P40202 QCR7YDR529C 384 nt0.6□□□□□ -2.31
CCS1P40202 CYC7YEL039C 342 nt0.6□□□□□ -2.31
CCS1P40202 RPL16AYIL133C 600 nt0.6□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YLR271WYLR271W 825 nt0.6□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YCL002CYCL002C 792 nt0.6□□□□□ -2.31
CCS1P40202 SEC1YDR164C 2175 nt0.6□□□□□ -2.31
CCS1P40202 GPM2YDL021W 936 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 SEM1YDR363W-A 270 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YMR254CYMR254C 309 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 NUT2YPR168W 474 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.59□□□□□ -2.31
CCS1P40202 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.58□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YPR099CYPR099C 357 nt0.58□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.58□□□□□ -2.32
CCS1P40202 PIG1YLR273C 1947 nt0.58□□□□□ -2.32
CCS1P40202 CDC24YAL041W 2565 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 PAN3YKL025C 2040 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YDR509WYDR509W 348 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YAP3YHL009C 993 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YBR012CYBR012C 420 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 CSM4YPL200W 471 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 YBR063CYBR063C 1215 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 NUT1YGL151W 3399 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 AIM44YPL158C 2277 nt0.57□□□□□ -2.32
CCS1P40202 FIG4YNL325C 2640 nt0.56□□□□□ -2.32
CCS1P40202 SET3YKR029C 2256 nt0.56□□□□□ -2.32
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