Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGAEP38570 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms