Protein–RNA interactions for Protein: P38192

RRT1, Regulator of rDNA transcription protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1P38192 PRM8YGL053W 714 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YHR054CYHR054C 1065 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YKL111CYKL111C 336 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT1P38192 SWS2YNL081C 432 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT1P38192 PAU24YBR301W 363 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT1P38192 KAP120YPL125W 3099 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YGL109WYGL109W 324 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT1P38192 TIM10YHR005C-A 282 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YLR366WYLR366W 306 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YNL114CYNL114C 372 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT1P38192 IRC23YOR044W 474 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT1P38192 APL3YBL037W 3078 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT1P38192 ZIP1YDR285W 2628 nt0.68□□□□□ -2.3
RRT1P38192 NUP145YGL092W 3954 nt0.68□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YDR220CYDR220C 294 nt0.68□□□□□ -2.3
RRT1P38192 SDS22YKL193C 1017 nt0.68□□□□□ -2.3
RRT1P38192 SWI5YDR146C 2130 nt0.67□□□□□ -2.3
RRT1P38192 SRP14YDL092W 441 nt0.67□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.67□□□□□ -2.3
RRT1P38192 PRE4YFR050C 801 nt0.67□□□□□ -2.3
RRT1P38192 RPS18BYML026C 441 nt0.67□□□□□ -2.3
RRT1P38192 CDC39YCR093W 6327 nt0.67□□□□□ -2.3
RRT1P38192 NOC3YLR002C 1992 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 UTP13YLR222C 2454 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 SAS3YBL052C 2496 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 IFH1YLR223C 3258 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YDL152WYDL152W 366 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 SNO3YFL060C 669 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YGL015CYGL015C 393 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YGR228WYGR228W 345 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 SNO2YNL334C 669 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YOP1YPR028W 543 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 YPR096CYPR096C 303 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 SHE9YDR393W 1371 nt0.66□□□□□ -2.3
RRT1P38192 AIM9YER080W 1884 nt0.65□□□□□ -2.3
RRT1P38192 TOF2YKR010C 2316 nt0.65□□□□□ -2.3
RRT1P38192 MPT5YGL178W 2580 nt0.65□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YCS4YLR272C 3531 nt0.65□□□□□ -2.31
RRT1P38192 NUT1YGL151W 3399 nt0.65□□□□□ -2.31
RRT1P38192 CLU1YMR012W 3834 nt0.64□□□□□ -2.31
RRT1P38192 HNT1YDL125C 477 nt0.64□□□□□ -2.31
RRT1P38192 RPC10YHR143W-A 213 nt0.64□□□□□ -2.31
RRT1P38192 PAM16YJL104W 450 nt0.64□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YCL002CYCL002C 792 nt0.64□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YPR117WYPR117W 7470 nt0.63□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YCR100CYCR100C 951 nt0.63□□□□□ -2.31
RRT1P38192 CYC7YEL039C 342 nt0.63□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YLR271WYLR271W 825 nt0.63□□□□□ -2.31
RRT1P38192 AIM44YPL158C 2277 nt0.63□□□□□ -2.31
RRT1P38192 PIG1YLR273C 1947 nt0.62□□□□□ -2.31
RRT1P38192 SEM1YDR363W-A 270 nt0.62□□□□□ -2.31
RRT1P38192 QCR7YDR529C 384 nt0.62□□□□□ -2.31
RRT1P38192 RPL16AYIL133C 600 nt0.62□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YBR012CYBR012C 420 nt0.62□□□□□ -2.31
RRT1P38192 NUT2YPR168W 474 nt0.62□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.62□□□□□ -2.31
RRT1P38192 CDC24YAL041W 2565 nt0.61□□□□□ -2.31
RRT1P38192 TMA22YJR014W 597 nt0.61□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YPR099CYPR099C 357 nt0.61□□□□□ -2.31
RRT1P38192 SCC2YDR180W 4482 nt0.61□□□□□ -2.31
RRT1P38192 RIM20YOR275C 1986 nt0.61□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YDR509WYDR509W 348 nt0.6□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YGR045CYGR045C 363 nt0.6□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.6□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YMR254CYMR254C 309 nt0.6□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.6□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.6□□□□□ -2.31
RRT1P38192 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.6□□□□□ -2.31
RRT1P38192 PAN3YKL025C 2040 nt0.6□□□□□ -2.31
RRT1P38192 SEC1YDR164C 2175 nt0.6□□□□□ -2.31
RRT1P38192 MKT1YNL085W 2493 nt0.6□□□□□ -2.31
RRT1P38192 SET3YKR029C 2256 nt0.59□□□□□ -2.31
RRT1P38192 snR9snR9 187 nt0.59□□□□□ -2.31
RRT1P38192 MND1YGL183C 660 nt0.59□□□□□ -2.31
RRT1P38192 YAP3YHL009C 993 nt0.59□□□□□ -2.31
RRT1P38192 CSM4YPL200W 471 nt0.59□□□□□ -2.31
RRT1P38192 UBP3YER151C 2739 nt0.59□□□□□ -2.32
RRT1P38192 APL2YKL135C 2181 nt0.59□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YDL206WYDL206W 2289 nt0.58□□□□□ -2.32
RRT1P38192 SCW11YGL028C 1629 nt0.58□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.58□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YAL066WYAL066W 309 nt0.58□□□□□ -2.32
RRT1P38192 RUF22RUF22 515 nt0.58□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YBR071WYBR071W 636 nt0.58□□□□□ -2.32
RRT1P38192 FIG4YNL325C 2640 nt0.58□□□□□ -2.32
RRT1P38192 NUP157YER105C 4176 nt0.57□□□□□ -2.32
RRT1P38192 NHP2YDL208W 471 nt0.57□□□□□ -2.32
RRT1P38192 BMT5YIL096C 1011 nt0.57□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.57□□□□□ -2.32
RRT1P38192 CMC4YMR194C-B 222 nt0.57□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YBR032WYBR032W 303 nt0.57□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YBR063CYBR063C 1215 nt0.57□□□□□ -2.32
RRT1P38192 STO1YMR125W 2586 nt0.56□□□□□ -2.32
RRT1P38192 GPM2YDL021W 936 nt0.56□□□□□ -2.32
RRT1P38192 snR84snR84 550 nt0.56□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YDR114CYDR114C 303 nt0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.9 ms