Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDXP35241 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDXP35241 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDXP35241 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDXP35241 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDXP35241 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDXP35241 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDXP35241 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDXP35241 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDXP35241 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDXP35241 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDXP35241 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDXP35241 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDXP35241 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDXP35241 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDXP35241 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDXP35241 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDXP35241 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDXP35241 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDXP35241 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms