Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms