Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RYKP34925 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYKP34925 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYKP34925 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms