Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 PEX4YGR133W 552 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 RPA34YJL148W 702 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 SCP160YJL080C 3669 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 RKM1YPL208W 1752 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.3□□□□□ -2.04
NIC96P34077 BRP1YGL007W 378 nt2.3□□□□□ -2.04
NIC96P34077 RPL32YBL092W 393 nt2.3□□□□□ -2.04
NIC96P34077 VPS13YLL040C 9435 nt2.3□□□□□ -2.04
NIC96P34077 ALK2YBL009W 2031 nt2.3□□□□□ -2.04
NIC96P34077 UBP1YDL122W 2430 nt2.3□□□□□ -2.04
NIC96P34077 NAM7YMR080C 2916 nt2.3□□□□□ -2.04
NIC96P34077 FKS3YMR306W 5358 nt2.29□□□□□ -2.04
NIC96P34077 SAP185YJL098W 3177 nt2.29□□□□□ -2.04
NIC96P34077 DFG16YOR030W 1860 nt2.29□□□□□ -2.04
NIC96P34077 CSN9YDR179C 489 nt2.29□□□□□ -2.04
NIC96P34077 GCN4YEL009C 846 nt2.29□□□□□ -2.04
NIC96P34077 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.29□□□□□ -2.04
NIC96P34077 STH1YIL126W 4080 nt2.29□□□□□ -2.04
NIC96P34077 PLC1YPL268W 2610 nt2.28□□□□□ -2.04
NIC96P34077 OST1YJL002C 1431 nt2.28□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.28□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.28□□□□□ -2.04
NIC96P34077 TMA10YLR327C 261 nt2.28□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.28□□□□□ -2.04
NIC96P34077 PET309YLR067C 2898 nt2.28□□□□□ -2.04
NIC96P34077 SGO1YOR073W 1773 nt2.28□□□□□ -2.04
NIC96P34077 RPL35AYDL191W 363 nt2.27□□□□□ -2.05
NIC96P34077 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.27□□□□□ -2.05
NIC96P34077 RPL42BYHR141C 321 nt2.27□□□□□ -2.05
NIC96P34077 YNL114CYNL114C 372 nt2.27□□□□□ -2.05
NIC96P34077 RPL42AYNL162W 321 nt2.27□□□□□ -2.05
NIC96P34077 BUD2YKL092C 3315 nt2.27□□□□□ -2.05
NIC96P34077 PEX8YGR077C 1770 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 GUP1YGL084C 1683 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 CAT2YML042W 2013 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 PHS1YJL097W 654 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 HHT1YBR010W 411 nt2.26□□□□□ -2.05
NIC96P34077 ARP7YPR034W 1434 nt2.25□□□□□ -2.05
NIC96P34077 TOF1YNL273W 3717 nt2.25□□□□□ -2.05
NIC96P34077 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.25□□□□□ -2.05
NIC96P34077 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.25□□□□□ -2.05
NIC96P34077 PAC1YOR269W 1485 nt2.25□□□□□ -2.05
NIC96P34077 PDR3YBL005W 2931 nt2.24□□□□□ -2.05
NIC96P34077 BNI1YNL271C 5862 nt2.24□□□□□ -2.05
NIC96P34077 TAR1YLR154W-C 375 nt2.24□□□□□ -2.05
NIC96P34077 YOR055WYOR055W 435 nt2.24□□□□□ -2.05
NIC96P34077 INO80YGL150C 4470 nt2.24□□□□□ -2.05
NIC96P34077 TFC8YPL007C 1767 nt2.23□□□□□ -2.05
NIC96P34077 NAB6YML117W 3405 nt2.23□□□□□ -2.05
NIC96P34077 TDA9YML081W 3756 nt2.23□□□□□ -2.05
NIC96P34077 PRE4YFR050C 801 nt2.23□□□□□ -2.05
NIC96P34077 YIL059CYIL059C 366 nt2.23□□□□□ -2.05
NIC96P34077 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.23□□□□□ -2.05
NIC96P34077 HER1YOR227W 3741 nt2.22□□□□□ -2.05
NIC96P34077 VPS34YLR240W 2628 nt2.22□□□□□ -2.05
NIC96P34077 IRC8YJL051W 2469 nt2.22□□□□□ -2.05
NIC96P34077 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.22□□□□□ -2.05
NIC96P34077 DNF1YER166W 4716 nt2.21□□□□□ -2.06
NIC96P34077 PDR11YIL013C 4236 nt2.21□□□□□ -2.06
NIC96P34077 ATG9YDL149W 2994 nt2.21□□□□□ -2.06
NIC96P34077 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.21□□□□□ -2.06
NIC96P34077 MCM22YJR135C 720 nt2.21□□□□□ -2.06
NIC96P34077 RGA1YOR127W 3024 nt2.2□□□□□ -2.06
NIC96P34077 MCD1YDL003W 1701 nt2.2□□□□□ -2.06
NIC96P34077 SSQ1YLR369W 1974 nt2.2□□□□□ -2.06
NIC96P34077 SEC16YPL085W 6588 nt2.2□□□□□ -2.06
NIC96P34077 YOP1YPR028W 543 nt2.2□□□□□ -2.06
NIC96P34077 SLN1YIL147C 3663 nt2.2□□□□□ -2.06
NIC96P34077 snR70snR70 164 nt2.19□□□□□ -2.06
NIC96P34077 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.19□□□□□ -2.06
NIC96P34077 HDA3YPR179C 1968 nt2.19□□□□□ -2.06
NIC96P34077 CHC1YGL206C 4962 nt2.19□□□□□ -2.06
NIC96P34077 OSH6YKR003W 1347 nt2.18□□□□□ -2.06
NIC96P34077 SCD5YOR329C 2619 nt2.18□□□□□ -2.06
NIC96P34077 snR51snR51 107 nt2.18□□□□□ -2.06
NIC96P34077 TOR2YKL203C 7425 nt2.18□□□□□ -2.06
NIC96P34077 COS111YBR203W 2775 nt2.18□□□□□ -2.06
NIC96P34077 NOP14YDL148C 2433 nt2.18□□□□□ -2.06
NIC96P34077 SWI6YLR182W 2412 nt2.18□□□□□ -2.06
NIC96P34077 SWI5YDR146C 2130 nt2.17□□□□□ -2.06
NIC96P34077 PDR8YLR266C 2106 nt2.17□□□□□ -2.06
NIC96P34077 HTL1YCR020W-B 237 nt2.17□□□□□ -2.06
NIC96P34077 YDR048CYDR048C 315 nt2.17□□□□□ -2.06
NIC96P34077 YGL149WYGL149W 306 nt2.17□□□□□ -2.06
NIC96P34077 YHL041WYHL041W 450 nt2.17□□□□□ -2.06
NIC96P34077 PAU18YLL064C 363 nt2.17□□□□□ -2.06
NIC96P34077 PAU6YNR076W 363 nt2.17□□□□□ -2.06
NIC96P34077 PXA2YKL188C 2562 nt2.17□□□□□ -2.06
NIC96P34077 STE11YLR362W 2154 nt2.16□□□□□ -2.06
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