Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms