Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIITAP33076 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIITAP33076 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIITAP33076 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CIITAP33076 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms