Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms