Protein–RNA interactions for Protein: P29992

GNA11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNA11P29992 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNA11P29992 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GNA11P29992 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNA11P29992 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNA11P29992 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNA11P29992 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNA11P29992 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNA11P29992 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNA11P29992 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNA11P29992 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms