Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB2P29033 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB2P29033 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB2P29033 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB2P29033 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB2P29033 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB2P29033 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB2P29033 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB2P29033 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB2P29033 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms