Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
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PTPRMP28827 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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PTPRMP28827 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
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PTPRMP28827 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
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PTPRMP28827 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
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