Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRBP28702 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRBP28702 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRBP28702 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRBP28702 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRBP28702 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRBP28702 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRBP28702 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRBP28702 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRBP28702 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRBP28702 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRBP28702 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RXRBP28702 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRBP28702 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRBP28702 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRBP28702 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRBP28702 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRBP28702 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRBP28702 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRBP28702 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRBP28702 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRBP28702 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRBP28702 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRBP28702 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRBP28702 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRBP28702 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRBP28702 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRBP28702 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRBP28702 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRBP28702 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRBP28702 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRBP28702 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms