Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms