Protein–RNA interactions for Protein: P28068

HLA-DMB, HLA class II histocompatibility antigen, DM beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMBP28068 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMBP28068 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms