Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMLP26374 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMLP26374 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMLP26374 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMLP26374 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMLP26374 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMLP26374 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMLP26374 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMLP26374 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMLP26374 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMLP26374 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMLP26374 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMLP26374 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMLP26374 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMLP26374 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMLP26374 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMLP26374 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMLP26374 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMLP26374 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMLP26374 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMLP26374 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMLP26374 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMLP26374 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMLP26374 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMLP26374 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMLP26374 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMLP26374 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms