Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA2P26232 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA2P26232 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA2P26232 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA2P26232 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA2P26232 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms