Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YY1P25490 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YY1P25490 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YY1P25490 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YY1P25490 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YY1P25490 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YY1P25490 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YY1P25490 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YY1P25490 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YY1P25490 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YY1P25490 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YY1P25490 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YY1P25490 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YY1P25490 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YY1P25490 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YY1P25490 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YY1P25490 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YY1P25490 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
YY1P25490 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YY1P25490 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YY1P25490 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms