Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4BP23588 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms