Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRGP23470 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
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