Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KB1P23443 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms