Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA5P20719 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms