Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms