Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms