Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms