Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HKR1P10072 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms