Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms