Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms