Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms