Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYCNP04198 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCNP04198 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCNP04198 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYCNP04198 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYCNP04198 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms