Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FGAP02671 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGAP02671 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGAP02671 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGAP02671 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FGAP02671 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGAP02671 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGAP02671 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGAP02671 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGAP02671 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGAP02671 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGAP02671 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGAP02671 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGAP02671 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGAP02671 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGAP02671 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGAP02671 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms