Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms