Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms