Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN1O94985 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms