Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAP30O75446 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SAP30O75446 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAP30O75446 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAP30O75446 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAP30O75446 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms