Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9AO75110 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms